Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms