Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD47Q08722 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD47Q08722 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD47Q08722 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD47Q08722 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms