Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms