Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms