Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms