Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms