Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLOD1Q02809 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms