Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms