Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms