Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms