Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MPP1Q00013 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MPP1Q00013 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms