Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGD1P98174 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FGD1P98174 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGD1P98174 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms