Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP1P63208 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms