Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms