Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK11-1P61568 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms