Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms