Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms