Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CABP4P57796 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CABP4P57796 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CABP4P57796 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms