Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB38P57729 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB38P57729 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms