Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLDN8P56748 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN8P56748 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms