Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A1P53007 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms