Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGDP52209 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGDP52209 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGDP52209 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGDP52209 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms