Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC32.14■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA4P51532 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms