Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms