Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME1P48163 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME1P48163 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME1P48163 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ME1P48163 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ME1P48163 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ME1P48163 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms