Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms