Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTR1BP42025 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms