Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms