Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms