Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD34P28906 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD34P28906 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD34P28906 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD34P28906 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD34P28906 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD34P28906 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD34P28906 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD34P28906 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms