Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX2P28328 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms