Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXP28300 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXP28300 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms