Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB4P28070 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms