Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA3P26006 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms