Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NFKBIAP25963 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms