Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNCP24821 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNCP24821 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNCP24821 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNCP24821 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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