Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPREP23469 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPREP23469 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPREP23469 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPREP23469 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPREP23469 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPREP23469 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPREP23469 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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