Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms