Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERBB3P21860 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERBB3P21860 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms