Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms