Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NME1P15531 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME1P15531 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME1P15531 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME1P15531 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME1P15531 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME1P15531 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME1P15531 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms