Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC130P13994 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms