Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMP1P11279 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMP1P11279 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms