Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C8orf88P0DMB2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C8orf88P0DMB2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms