Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms