Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBP07199 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms