Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms