Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN7O95471 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms