Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN11O75508 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN11O75508 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms