Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SS18L1O75177 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L1O75177 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms